瘧疾主要是一種蚊媒傳染性疾病，因此多發病於夏季。由於蚊媒傳播是瘧疾的最主要傳播途徑，而瘧疾就是重要的蚊媒傳染病，按蚊是傳染人瘧疾的唯一媒介。在我國已知有五十六種按蚊中，其中有五種被證明是傳播瘧疾的主要媒介。有一些低瘧原蟲血癥的患者，雖然血塗片檢查陰性，但輸血後仍然可能使受血者感染而發病。

瘧疾也可以通過胎盤傳播，人體普遍對瘧原蟲易感，多次發作或重複感染後再發症狀輕微或無症狀，表明感染後產生了一定的抵抗力。為了切斷傳染源要注意滅蚊，防止被蚊蟲叮咬。