哺乳期的母親吸菸，產生的二手菸同樣可以被嬰兒通過呼吸系統攝入到體內，產生對呼吸系統的影響。煙霧中的有毒、有害物質像苯、有機物、重金屬等，依然可以通過乳汁被胎兒攝取體內，對胎兒的影響也非常明顯。母親吸菸不光是通過呼吸系統對胎兒造成影響，也可以通過乳汁被胎兒吸收。哺乳期的嬰兒是在人一生當中生長發育最快的時期，如果攝入了有毒、有害物質，對生長發育的影響顯而易見。
母親吸菸產生的二手菸對嬰兒呼吸系統的影響也非常明顯，嬰兒期的呼吸系統處在高速發育的時期，如果吸入大量的二手菸，對兒童將來產生呼吸系統疾病的風險明顯增加。這些嬰兒將來發生呼吸道過敏或者呼吸道喘息性疾病的風險明顯增加，這一部分嬰兒呼吸系統免疫功能也受到了二手菸的影響，發生呼吸道感染性疾病的風險也明顯增加。