支氣管鏡檢查為呼吸系統常見檢查手段，對氣管、支氣管病變、肺門腫塊、肺門佔位、肺結核、肺不張及支氣管內異物等診斷和治療均有重要價值。臨床支氣管鏡檢查常見併發症如下：

1、麻醉藥過敏：全麻下支氣管鏡檢查，患者可出現麻醉藥過敏，部分患者出現鼻部出血、咯血、發熱及感染等；

2、喉頭水腫：患者可在操作過程中因為操作用力過猛，導致局部軟組織損傷而引起喉頭水腫，患者出現呼吸困難，若水腫較明顯則需立即搶救；

3、低氧血癥：醫生進行氣管鏡時會對患者進行血氧飽和度監測。部分患者可出現窒息感覺，部分患者合併慢阻肺等基礎疾病時會出現低氧；

4、氣急及氣道痙攣：無論患者有無症狀均可用氨茶鹼進行預防性治療；

5、肺功能不全：可在活檢後發生少量出血或繼發性支氣管痙攣；

6、心跳驟停：因患者本身具有基礎心臟疾病，在強烈氣道刺激情況下可出現惡性心律失常，導致心跳驟停；

7、氣道腫瘤：患者通過支氣管鏡檢查發生氣道內播散；

8、其他：自發性氣胸、縱隔氣腫，食管、氣管穿孔以及氣道梗阻等，一般均與支氣管鏡治療操作有關，若醫生操作過程中注意，即可避免部分併發症發生。