氣管鏡檢查的不舒服或者危害如下：

1、主要是咳嗽，因為氣管很敏感，有任何物體進入到氣管以後，本能的就會咳嗽。在做之前通過噴麻藥，會把咳嗽感覺儘可能降低但仍存在；

2、如果氣管鏡要做檢查或者治療，比如取活檢，有可能會造成出血，甚至可能造成支氣管破損，引起氣胸。出血一般量不大，通過藥物止血治療，一般都會好轉，但是要小心大出血的情況。最嚴重的情況下需要進行急救、搶救，通過止血以後，才能把問題徹底解決。

氣管鏡檢查不管是呼吸內科還是胸外科，經常會選擇的一項檢查。氣管鏡是有創檢查，通過咽喉部、鼻咽部局麻後，將細的纖維支氣管鏡通過聲門進入氣管，然後再往下到各級支氣管，觀察氣管裡面有沒有病變。