新生兒出現腸梗阻在臨床當中是常見的一類疾病，主要的原因多數是跟新生兒先天腸道畸形，與先天性的疾病有密切關係。

臨床上常見的有先天性巨結腸，可以採取保守治療，對症觀察治療，定期的擴肛，如果能夠改善腸梗阻的症狀可以繼續觀察，不能改善的也可以考慮手術切除，重新做腸管吻合。

腸道畸形或出現了腸道旋轉不良等先天性的疾病，多數是通過手術進行處理，包括腸管切除及吻合以及進行腸造瘻等手術方式，手術措施都能夠緩解新生兒到腸梗阻。也要在術前對新生兒做全面的評估以免發生危險，應該降低手術風險。