垂體瘤主要位於垂體窩內，而垂體窩是位於顱前窩和顱中窩交界區域，直徑約2cm的凹陷。垂體窩周圍存在重要神經，有視神經以及支配眼球神經和三叉神經，以及頸內動脈和其他重要的動脈從旁邊穿過。

如果從眉心到後腦畫一條直線，再從兩側太陽穴畫一條直線，這兩條直線的交界點即為垂體瘤在體表的大致投影。還可以理解為垂體瘤位於人顱腦底面正中心的位置。基於解剖學基礎，治療時可以選擇路徑最短的經鼻-蝶竇垂體瘤切除術。該手術方式最為直接，損傷最小。