甲狀腺癌，根據病理類型可分為大概四類：第一類是甲狀腺乳頭狀癌；第二類是甲狀腺濾泡狀癌；第三類是甲狀腺的未分化癌；第四類是甲狀腺髓樣癌。

除了甲狀腺髓樣癌外，其他的三種癌都起源於濾泡上皮細胞。其中，臨床上最常見的是甲狀腺乳頭狀癌。甲狀腺乳頭狀癌佔成人甲狀腺癌總數的70%。而兒童發生的甲狀腺癌，基本上都是屬於甲狀腺乳頭狀癌。甲狀腺乳頭狀癌分化好，生長緩慢，惡性程度低。但甲狀腺乳頭狀癌較早期可以出現頸部淋巴結的轉移。甲狀腺乳狀癌的愈後是比較好的。甲狀腺濾泡狀癌約佔甲狀腺癌的15%左右，頸部淋巴結轉移約佔10%，因此愈後不如乳頭狀癌。甲狀腺惡性程度最高的癌，是未分化癌。未分化癌愈後很差，一般早期即向遠處浸潤、如血行轉移、淋巴結轉移，平均的生存期大約是三個月到半年，一年的存活率僅為5%到15%。此類癌是甲狀腺癌惡性程度最高的癌症。