新生兒肺動脈高壓，根據不同的病因，效果不太一樣。如果原發病是肺血管適應不良，比如缺氧導致的肺動脈血管暫時性高壓，在缺氧糾正以後，痙攣的肺血管可能慢慢舒張，甚至會慢慢好轉，比較容易治療，大部分能夠治好。如果是其他原因導致新生兒肺動脈高壓，比如少見的平滑肌增生或者肺血管發育異常、複雜先心病導致的迴流受阻等，此時肺動脈高壓治療比較困難，較難治好。但是，新生兒肺動脈高壓大部分是因為肺血管適應不良，所以新生兒肺動脈高壓大部分能治好。