室間隔缺損手術包括兩個大的類型：第一個，是內科的微創介入手術；第二個是外科的開胸手術。對於內科微創的介入手術而言，手術費用是和患者所使用的手術器械相關的。

一般來說，一個室間隔缺損進行介入封堵的費用，大約是在3萬塊錢左右。如果是兩個缺損，就是兩個洞口，這時候費用可能就會翻倍，大約在5-6萬塊錢左右。對於部分患者，如果需要進行外科開胸手術，費用相對來說要便宜一點，可能在2萬塊錢左右，就能把手術做下來。因為術中不需要使用貴的醫療器械，但是創傷來說，要大的多，這是它的優點和缺點。