亞急性甲狀腺炎多見於女性，近年來逐漸增多，臨床變化複雜，常有誤診及漏診。本病起病可急可緩，病程長短也不一，可持續數週至數月，也有1-2年。本病預後良好，可以自然緩解，一些患者在病情緩解後數月內還可能再次復發或多次復發，但最終甲狀腺功能回到正常。本病發作前常有上呼吸道感染的病史，如咽喉疼痛、發熱，可有甲狀腺不同程度的腫大和甲狀腺疼痛。疼痛可放射至下頜、頸後等部位，甲狀腺觸痛較為明顯，復發患者在停藥後1-2個月症狀相對較前輕。
一般大多數患者適當休息，僅對症處理即可，對輕型病例採用止痛藥即可控制症狀。病情嚴重者如疼痛、發熱明顯，可伴有甲狀腺功能亢進症狀，可短期使用非類固醇抗炎藥或應用糖皮質激素即可迅速緩解病情。使用糖皮質激素治療需要持續用藥6-8周。本病會暫時伴甲亢，亞急性甲狀腺炎破壞甲狀腺濾泡，釋放過量的甲狀腺激素，通常採用β受體抑制劑治療即可奏效。本病的甲減也是暫時的，病情較重者可少量使用甲狀腺激素替代一段時間，大約有10％的患者可能發生永久性甲減，需要長期甲狀腺素替代治療。