典型的亞甲炎可以有高熱、劇烈疼痛以及血沉加快，這時可以伴輕微甲亢。其是自限疾病，不做治療大部分患者會自己逐漸恢復正常。急性期出現高熱、疼痛，以及甲亢症狀，通常1-2個月即可恢復，所以亞甲炎急性期疼痛需要治療。

若有明顯發熱、疼痛，可給予解熱止疼藥，緩解疼痛。若病情較重、面積較大，緩解疼痛通常用糖皮質激素、強的松這類藥物，短期用1個月左右即可。糖皮質激素、強的松副作用影響不大，短期可以用。所以治療很簡單，一是解熱止疼，必要時應用少量糖皮質激素。若症狀輕不用做任何治療，只要定期查血，觀察2-3月可以自行恢復。

亞甲炎也稱為亞急性甲狀腺炎，是由於自身免疫相關的一些疾病引起甲狀腺炎性反應，不是感染性炎症，而是免疫性炎症。比如前面出現感冒、病毒感染，若干時間以後甲狀腺類似於過敏反應，開始發炎，引起甲狀腺損傷，損傷以後若面積大可以有疼痛、發熱等類似於感染。