亞急性甲狀腺炎常有前驅感染，此種前驅感染多為上呼吸道感染，可出現流涕、咽痛、感冒等經久不愈症狀，患者可逐漸出現頸部疼痛，一般是頸部正中疼痛，有時可以放射到牙齒或耳後，會誤認為是牙齒髮炎，或耳朵發炎等疼痛症狀。此外，還可出現低熱，一般表現為傍晚發熱，如下午6-7點鐘出現，體溫通常是在37-38℃，但有時也會表現為高熱。出現發熱以後，在晚上可出現出汗，出汗以後體溫多能夠降下來，一般到早上以後體溫就恢復正常。以上是亞急性甲狀腺炎非常常見症狀，在臨床中比較有特異性症狀就是發熱和頸部疼痛。

如果出現發熱和頸部比較明顯疼痛，要懷疑亞急性甲狀腺炎，在醫生檢查身體時也會發現頸部，尤其是在甲狀腺區域，會出現質地比較硬的炎症性包塊，或出現非常明顯的觸痛，一摸甲狀腺就會發生嚴重疼痛，這時就要懷疑亞急性甲狀腺炎。