臨床上並沒有膽囊結石最佳治療時間的說法，其治療時間需根據具體病情決定。因為藥物治療通常不能根治膽囊結石，所以臨床治療以手術切除膽囊為主，多選擇腹腔鏡下膽囊切除術，一般只要在結石造成惡性病變之前切除，多數不會造成嚴重後果，不同情況的膽囊結石手術時間一般不同。

對於兒童膽囊結石以及無症狀膽囊結石，一般不治療，只需要定時複查；有症狀的膽囊結石，以及膽囊結石合併慢性膽囊炎，非進行發作期者，膽囊切除手術並不緊急，大多不會因為手術晚一些或早一些造成嚴重後果，因此不必由於手術安排較晚或有其他原因需要延遲手術而緊張。通常在結石數量多或直徑過大、膽囊壁增厚鈣化、伴膽囊息肉者以及易在後期出現症狀和併發症等情況時，建議擇期手術治療。擇期手術一般沒有所謂的最佳治療時間，根據醫院的安排手術時間進行即可，如果患者身體狀況不佳，存在貧血、脫水等情況，就需要將身體各項指標調整至基本正常後再進行手術。

膽囊結石合併膽囊炎急性發作者，可儘早行腹腔鏡下手術切除，以免炎症引起的滲出、腫脹持續發展影響手術視野，造成鏡下手術困難，甚至需要轉為開腹手術。對於炎症反應過重的患者，比如存在肝膽區疼痛、黃疸、發熱等症狀，可先進行抗炎治療，炎症消退後再行擇期手術。

由於膽囊結石會對膽囊壁造成持續的刺激，容易引起膽囊炎，膽囊長期的炎症反應，可導致膽囊壁增厚，喪失儲存和濃縮膽汁的功能，嚴重者甚至可能出現膽囊癌。此外結石順著膽管排出的過程容易卡在胰腺導管，易引發急性胰腺炎，出現左腹劇痛等症狀，如果合併感染，病情比較危急。因此發現膽囊結石，要儘早就醫治療，一般切除膽囊後並不會對消化功能造成太大影響，產生的影響與不切除相比要小的多，因此臨床較為提倡有手術指徵的膽囊結石患者切除膽囊。