造血幹細胞移植是用正常的幹細胞，替代病人的幹細胞，抑制腫瘤的生長，改善免疫細胞的異常，讓患者恢復正常造血和免疫功能。造血幹細胞移植屬於大劑量的化療，自體造血幹細胞移植不存在排斥問題，異基因造血幹細胞移植存在急性排斥和慢性排斥反應。急性排斥是移植後100天以內的排斥反應，常見皮疹、皮膚瘙癢、肝臟排斥、肝功能異常、嘔吐、膽紅素增高、腸道排斥等症狀，可能導致白血病復發或死亡。慢性排斥是移植100天后出現排斥反應，對患者影響較輕。