系統性紅斑狼瘡是全身多臟器受累的自身免疫性疾病，臨床表現可以多種多樣，可以出現皮疹、脫髮、口腔潰瘍、胸腔積液、間質性肺炎、蛋白尿、血尿、關節炎等，所以如果有關節炎的情況下，患者會有關節腫脹、關節疼痛情況。患者可有口腔潰瘍，一般的紅斑狼瘡的口腔潰瘍是一種無痛性的口腔潰瘍，但是如果合併感染，該類潰瘍表現疼痛明顯。如果肺部受累可能會有胸腔積液，少量的胸腔積液在呼吸時，也可以引起呼吸時胸疼。
系統性紅斑狼瘡本身的病變基礎為血管炎，全身都可以受到累及，如果累及到胃腸道，可以引起胃腸道消化道出血或者胃痛、牽涉痛等情況。所以系統性紅斑狼瘡可以引起疼痛，具體是何種部位疼或者疼痛的方式，需要觀察受累的臟器和部位決定。