腸瘻危害較多、較嚴重，而且有許多為致命性危害。不同腸液、不同胃液酸鹼、化學值不一樣，胃呈酸性，腸子都是鹼性，所以一旦出現腸瘻，首先漏到腹腔裡是一種化學性腹膜炎，一旦腹膜炎處理不好變成感染性休克，可能直接導致患者死亡。

腸瘻還分為內瘻和外瘻，內瘻指腸子裡器官漏到腹腔裡或小腸東西漏到大腸裡即短腸子，還沒吃點東西就拉出來，影響營養吸收。部分腸瘻是漏到膀胱裡，尿出大便，部分漏到陰道里，陰道出大便等叫內瘻。外瘻是漏到體腔外面來，最多見通過刀口、傷口漏到腹壁。

腸瘻腐蝕性較大，都是鹼性消化液，腹壁瘻口較紅、腫，看不見正常皮膚，紅彤彤，全是鮮肉樣組織即消化液在消化著正常組織，是外瘻表現。腸瘻會造成患者大量營養丟失，腸瘻患者都是骨瘦如柴，躺著肋骨都看得一清二楚，腸管紅彤彤，特別消瘦，腸瘻對人體營養消耗較大，再引起其它各種疾病等。總之，一旦出現腸瘻，意味著住院時間長，花費較大，醫生也覺得很無能為力，部分患者面臨著失去生命的危險。因此，腸瘻危害較大。