甲狀腺癌的預後取決於甲狀腺癌的類型，甲狀腺癌的四種類型包括乳頭狀癌、濾泡狀癌、甲狀腺髓樣癌以及未分化癌。前兩者屬於分化型甲狀腺癌，預後較好，可以達到治癒的結局。但如果發現較晚或屬於後兩類，則預後不佳。

常規提到的甲狀腺癌為分化型甲狀腺癌，它的轉移與復發均較慢，患者進行手術治療、碘-131治療以及口服左甲狀腺素鈉片的TSH抑制治療效果均較好。所以當罹患甲狀腺癌時無需緊張，但若患有髓樣癌或未分化癌則預後不佳。