如果甲狀腺癌是乳頭狀癌或濾泡狀癌、髓樣癌，可能侵犯氣管，局部做氣管切除、吻合，可以根治，效果較好。

如果甲狀腺癌是未分化癌，引起的氣管浸潤，即使有做手術的機會，效果也不好。因為未分化癌容易出現遠處轉移，容易逐步出現復發。而且在這種情況下，未分化癌侵犯氣管，如甲狀腺癌引起氣管狹窄，患者沒有辦法呼吸，才考慮手術治療。如果未分化癌侵犯氣管，通常不主張首選手術治療。