偏頭痛是常見的神經系統疾病之一，呈單側搏動性中重度疼痛，可導致生活質量顯著下降。偏頭痛，尤其是那些伴有先兆的偏頭痛患者發生中風的風險會增加，這在觀察性研究中有明確記錄。偏頭痛與中風之間的聯繫機制尚未完全確定，但可能涉及動脈粥樣硬化加速、血管痙攣、內皮功能障礙、特定部位引起的低氧血癥和反常栓塞等。反常栓塞是指靜脈系統和右心房的血栓通過心臟內的交通從右心繫統進入左心繫統，引起缺血性腦卒中和心、腎以及外周系統栓塞。右向左分流最常見的病因是卵圓孔未閉。偏頭痛患者的卵圓孔未閉頻率明顯較高，尤其是伴有先兆的偏頭痛患者。研究發現這兩個相對普遍的臨床實體之間存在因果關係。第一個支持性的證據是卵圓孔未閉封堵術可以減少偏頭痛的發作。另外，有研究發現血管活性物質（如血清素）通過卵圓孔從肺循環中逸出而積聚在腦血管中，而血管活性物質通常在肺循環中代謝。這些血管活性物質，可能損害腦血管運動反應性和自我調節能力。降低腦血管運動反應性減慢了微栓子的清除，腦血管運動反應性損害可能是某些觸發因素的中介機制，這個機制填補了偏頭痛病理生理學的一些空白。有研究證明，高等級右向左分流的存在與偏頭痛患者血管舒張性降低有關。如果偏頭痛患者的卵圓孔未閉值較大，那麼通過傳遞函數分析指標量化的腦壓自動調節功能受損程度更大。