對於任何惡性腫瘤而言，均具有一定的遺傳傾向性，膽管癌也不例外，但是總體而言，膽管癌的遺傳傾向較小，即概率較低，臨床上發現的概率可能不足1%。在臨床上較難見到父母患有膽管癌，子女又同時發生膽管癌。反而父母如果有其他的惡性腫瘤，子女又發生另外一種惡性腫瘤的可能性相對較高，因此對於膽管癌而言，其遺傳幾率較低。

通過科研對膽管癌患者進行基因方面的檢測，也較難發現在不同患者身上，有共同的基因群特徵，因此膽管癌的遺傳幾率相對較低。膽管癌的發病主要原因，並不在於遺傳，而在於部分特異性原因，主要是以下原因：

1、膽管結石：包括肝內的膽管結石，或者是肝外的膽管結石。結石容易造成膽管炎症，也容易對膽管壁造成摩擦，從而發生癌變；

2、寄生蟲：膽管內的寄生蟲，包括華支睪吸蟲，但目前此疾病已經較為罕見；

3、硬化性膽管炎：屬於膽管的早期癌變，但硬化性膽管炎也屬於相對比較罕見的疾病；

4、先天性膽管擴張症：即肝內、肝外的膽管成囊狀擴張，隨著年齡增長，其擴張會越來越明顯直至發生癌變，屬於一種先天性疾病，也具有一定的遺傳因素。但是其遺傳並不常見，一般是個體、特異性的發生，與父母並沒有相對的關係。雖然是先天性疾病，也需要及早進行處理，但是其遺傳幾率並不高，因此患者不需要過多擔心。