膽管癌分為肝內膽管癌與肝外膽管癌，針對不同位置腫瘤，治療方式存在區別，預後也有所不同。膽管癌患者早期均應進行手術切除，且手術切除屬於唯一根治性治療方案。通常可根據腫瘤大小、位置，及區域淋巴結有無轉移、有無遠處臟器腫瘤轉移等決定能否進行手術治療，但手術方式存在一定差異。

若無法進行根治性切除，對於肝內膽管癌可進行介入治療，即常用的TACE肝動脈支管栓塞或肝動脈置管持續性灌注化療。目前針對於膽管癌並沒有臨床批准使用的靶向藥物，但多項臨床試驗已證實目前上市的數個靶向藥物，對膽管癌有較好治療效果，但放療或化療對於膽管癌治療效果較差。