通常在臨床上，如果患者確診為膽管癌，預後比較差，而且5年生存率也比較低。膽管癌患者早期一般沒有明顯的症狀，與胃癌、腸癌不同，胃癌早期會出現腹痛，腸癌早期可出現大便習慣改變。絕大多數膽管癌患者的首發症狀是黃疸，即皮膚髮黃、眼睛發黃、尿色變深，但是出現黃疸通常並不是處於早期，可能已經處於較晚期。

因此，在患者確診膽管癌後，如果有手術機會，應儘早進行手術治療，通過手術將癌灶切除，再配合其它的治療，比如放療、化療等。而對於膽管癌的切除，需要進行胰十二指腸切除的大手術，所以術後併發症的發生率也比較高，患者的生活質量比較差。但是多數患者在確診後，通常已沒有手術機會，只能進行姑息性治療，比如內引流手術或者外引流手術，再配合放療、化療。通常以儘量延長患者的生存期、提高生存質量為目的，進行個體化的治療。