早期膽管癌患者術後可能獲得根治，可獲得長期生存，而對於進展期膽管癌，術後面臨復發轉移的風險，膽管癌復發後往往預期生存時間只有不到1年時間，而晚期膽管癌不適合手術治療。提高膽管癌患者的總體生存時間，關鍵在於早期發現、早期進行外科手術治療。

手術切除範圍需根據膽管癌具體生長部位而定，膽管癌可長在肝內或肝外，手術切除包括肝部分切除、膽管癌切除，以及聯合胰腺、十二指腸等大範圍切除。不同膽管癌的惡性程度存在差別，部分膽管癌合併淋巴結轉移，此時預後較差，部分膽管癌惡性程度相對較低，預後會更好。部分膽管癌患者可通過手術獲得治癒，但對於存在復發風險的膽管癌患者，建議術後進行化療，化療可在一定程度上推遲腫瘤復發時間。膽管癌出現復發轉移時，往往不能手術治療，而只能藥物治療。