膽管癌術後可以復發，在各種惡性腫瘤當中膽管癌複發率相對更高。因為膽管癌腫瘤與胰腺癌、膽囊癌都屬於膽類惡性腫瘤。對於化療、放療以及其它治療都不敏感，早期有可能會出現淋巴結和視神經侵犯轉移，即切除腫瘤還存在細微看不見腫瘤組織潛伏在淋巴結、血液當中，造成術後復發。所以，這種因素造成膽管癌手術容易術後復發。現在文獻報道五年複發率大概70%，所以大部分患者因為手術時沒有在病程早期，術後複發率較高。

部分患者術後要積極隨訪觀察，如果一旦出現復發，早期積極應對。所以，對於惡性腫瘤復發一般都不可避免。只有在腫瘤早期早點發現腫瘤，術後複發率相對較低。晚期已經進行手術以後，需要術後進行嚴密隨訪，同時可以配合相關輔助治療，例如化療、放療，甚至免疫治療預防腫瘤復發和轉移，最終達到延長患者生存時間，改善患者預後的目的。