肝癌分為原發性肝癌和繼發性肝癌，單從二維上鑑別相對比較困難，通常需要結合病史進行鑑別。原發性肝癌患者通常有肝硬化、乙肝病史，可表現為小三陽、大三陽、AFP增高，此時需結合CT、磁共振和造影綜合判斷是否為原發性肝癌。若高度可疑，可在超聲引導下進行穿刺活檢，取得組織後送病理科化驗，明確診斷。

繼發性肝癌需明確患者有無直腸癌、胃癌、肺癌等原發病史。部分患者有部分特殊性病變，如牛眼徵，也需做增強CT、磁共振，甚至需要進行穿刺活檢，通過病理的方式明確診斷。