原發性肝癌術後不一定需要化療，但部分病人建議化療。如果出現危險因素，則需進行化療，如微血管侵犯。腫瘤部位與大血管關係密切，術後AFP下降不明顯，或AFP始終處於高水平，則系統性化療尤為重要。

除系統性化療外，系統治療包括全身性靶向藥物治療、免疫治療。目前靶向聯合免疫治療，已成為原發性肝癌術後預防復發的重要手段。原發性肝癌術後化療，也可以分為全身性化療、局部化療。局部化療主要是通過介入的方式，穿刺到肝臟動脈後注射化療藥，也可起到預防腫瘤復發的效果。