肝吸蟲病的病因主要是攝入含有肝吸蟲囊蚴的未煮熟魚、蝦等，或直接食用生蝦、生魚片。此外，使用被肝吸蟲的蟲卵沾染過的面板或菜刀、蔬菜，如生菜與生魚接觸、汙染，直接飲用含有肝吸蟲病原的水，如山區野遊，飲用含蟲卵的水，可能感染肝吸蟲病。肝吸蟲病的潛伏期通常1-2個月，若短時間內攝入大量含有肝吸蟲囊蚴的生魚、蝦，可能急性發病，時間縮短為15-25天。