腦梗塞的預後取決於梗塞的大小和部位。小面積腦梗塞，如放射冠區腦梗塞患者，臨床症狀和體徵常常較輕，經過積極治療以後，多數可以臨床治癒，一般不遺留後遺症。對於大面積腦梗塞，腦幹梗塞和基底節區腦梗塞患者，臨床表現常常較重，一般多數可以留有後遺症。

腦幹是人體的生命中樞，即使小的梗死灶，也可能會危及生命。基底節區是神經纖維集中的地方，如果病變侵犯內囊，患者可以出現偏癱、偏盲、偏身感覺障礙，多數患者可以留有後遺症。大面積腦梗塞患者，可以出現腦水腫、顱內壓增高，還可以出現腦疝，甚至導致死亡。