原則上腦梗塞的病人需要一輩子吃藥，醫學上稱為二級預防。因為腦梗塞的病人如果終止服藥，則有可能損害正常的血管內皮，在損害的血管內皮表面形成新的血栓，從而堵塞腦血管，導致腦梗塞復發。對於心源性疾病造成的腦梗塞，如果不堅持服用抗凝藥物，則有可能會形成新的栓子脫落堵塞大血管，造成嚴重的後果。

腦梗塞的病人原則上需要終身服藥，常用的藥物包括抗血小板藥以及抗凝藥、他汀類藥物等等。如果患者因為服藥出現消化道出血、肝功能損害、肌炎等併發症，則可暫停服藥。通常這些併發症多為一過性，經過對症處理後患者可恢復，此時仍然需要繼續吃藥。而由於終止服藥，造成腦梗塞病人二次復發甚至三次復發的情況並不少見。因此，做好腦梗患者的健康宣教十分重要。