顱內生殖細胞瘤通常分為生殖性生殖細胞瘤和非生殖性生殖細胞瘤。對於愈後較好的生殖性生殖細胞瘤，五年的存活率達到90%以上，即大部分生殖細胞瘤患兒可以治癒，且不會復發。部分患者可能有約20%-30%的複發率。

治癒包括生理上的治癒和心理上的迴歸。對於生理上的治癒，大部分生殖細胞瘤可以治癒。但生殖細胞瘤好發於青少年，對於患兒和青年人而言，生理治癒以後的心理迴歸和社會的功能的恢復尤為重要。