脊柱裂是存在一定遺傳性的，相關研究證實，如果既往有一個脊髓脊膜膨出生育史者，發病率會增加至2%-3%；有兩個為6%-8%。如果家族近親，比如兄弟姐妹中有脊髓脊膜膨出生育史，發病風險也會增加，尤其是母系親屬。

因為脊髓脊膜膨出屬於脊柱裂的一種類型，因此脊柱裂是具有遺傳性的。同時戰爭、饑荒和經濟困難期發病率也會增加，但戰後發病率逐漸降低。遺傳遵循非孟德爾遺傳法則，可能為多因素致病，產前補充葉酸能夠降低脊柱裂的遺傳性。