腦血管畸形介入栓塞術後，可能會出現一些後遺症。這些後遺症主要與介入栓塞術後局部腦組織的缺血，或者局部出血有關。主要表現為神經功能障礙，比如肢體無力、偏癱、偏身感覺障礙、視野缺損、偏盲。有的患者可能會由於出血，或者腦梗死的範圍比較大，而出現不同程度的意識障礙，像昏迷，甚至植物生存等狀況。還有一部分患者由於腦部的皮層受到影響，引起腦細胞的異常放電，使患者出現癲癇發作。

總體來說，腦血管畸形是臨床上治療起來比較棘手的一類疾病，介入栓塞術作為腦血管畸形治療的一種重要手段，相對比較安全。但是對於比較巨大的、多支供血動脈供血和深靜脈引流的血管畸形，以及畸形團內有高速血流，有比較快捷的通路存在時，介入栓塞後也有可能會出現後遺症的情況，主要表現為上述所提到的神經功能障礙。