顱咽管瘤二次手術風險與初次手術相同，發生風險增加。

顱咽管瘤是生長於鞍上區一種常見先天性腫瘤，手術風險較高，由於其累及重要血管、神經，例如雙側頸內動脈、上方視神經以及後上方三腦室及下丘腦等重要結構。顱咽管瘤復發再次手術，風險將比初次手術增加很多，這是由於腫瘤出現復發很可能是由於殘留無法抵達手術區域腫瘤出現再次生長，再次手術抵達上次不能抵達手術區域存在困難。由於初次手術局部出現瘢痕粘連，正常結構和腫瘤之間界面分離將會增加很大難度，導致周圍血管神經損傷幾率增高。