在保證患者功能的前提下，把腫瘤徹底切除乾淨，這個病就治癒了。因為它本身是一個良性腫瘤，如果腫瘤不復發就治癒了。所以根治是指從腫瘤不再生長，不再復發的角度講。但是有的時候顱咽管瘤會影響青少年的生長發育。

生長發育需要內分泌科、婦科等幫助進行功能重建，使其恢復到正常人的功能。還有一種情況，如果腫瘤不能徹底切除乾淨，換句話說，殘留部分腫瘤的時候，常常需要配合腫瘤的放射治療。放射治療主要防止腫瘤繼續增大或生長，給病人造成災難性的影響。