手術分流是治療脊椎空洞症的一個比較常用的方法，但是脊髓空洞症的治療方法比較多，具體選用何種治療方法主要取決於脊髓空洞的原因。由於外傷、炎症或者其他因素導致空洞，如果沒有明確需要去除的原因，可以對空洞進行分流手術。空洞的分流手術可以將脊髓空洞分流到椎管的蛛網膜下腔，也可以根據就近的位置分流，比如胸段的脊髓空洞可以分流到蛛網膜下腔或者胸腔，腰段的脊髓空洞也可以分流到相應的蛛網膜下腔。

此外，脊髓空洞症最常見的原因是小腦扁桃體下疝，英文名稱Chiari畸形，是由於先天或者後天的原因引起小腦扁桃體肥大，疝入枕骨大孔，影響顱頸交界區的腦脊液循環，造成脊髓的中央網擴張，逐漸形成脊髓空洞。所以這類疾病的治療方式是進行後顱窩減壓和顱底重建手術，從根源治療脊髓空洞。