先天性脊髓拴系綜合徵能否治癒，主要取決於脊髓拴系的嚴重程度，以及手術處理前患者的神經功能障礙程度等諸多因素，其中原發損傷的嚴重程度較為關鍵的因素。如果先天性脊髓拴系綜合徵發生在脊髓、脊膜膨出的患者，通常是由於脊髓通過局部的脊柱的缺損部位向外膨出，最終導致脊髓出現損傷。

患兒如果同時出現雙下肢的無力乃至截癱，或出現大小便失禁。即使通過手術的方式進行脊髓拴系的鬆解，以及硬脊膜囊的修補，患兒的神經功能也難以完全恢復到正常狀態。而如果患兒只是終絲增粗且下肢出現疼痛，或者剛出現無力和尿頻，甚至排便困難等情況時。經過脊髓拴系的鬆解的手術治療後，患兒的神經功能可能恢復到正常。所以脊髓拴系的嚴重程度越輕，以及患兒的神經功能障礙程度越輕，通常越有希望獲得治癒。