尿路結石依據結石所在的部位不同，而疼痛部位也略不相同。

1、腎臟結石通常位於後背區域，肋脊點或肋腰點處。即後背脊柱正中與第12根肋骨的交點處，或後背脊柱正中旁的肌肉與第12肋骨交點處，此部位的疼痛要考慮是腎臟結石、腎盂腎炎；

2、輸尿管上段的結石疼痛大多位於上腹部，即肋骨下緣5cm大小範圍區域的疼痛，疼痛可向後背部進行放射；

3、輸尿管下段結石通常位於下腹部，即髂骨區域附近的腹部。疼痛會向會陰區、外生殖器部位放射，有時部分患者可放射至睪丸、陰唇；

4、膀胱結石通常位於恥骨上的區域，出現慢性的疼痛並伴有排尿中斷的現象；

5、尿道結石通常疼痛位於尿道之內，伴有尿頻、尿急、排尿困難、排尿分叉、肉眼血尿的症狀。