淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎的區別在於：

1、病原體不同：淋菌性尿道炎是淋球菌感染引起，非淋菌性尿道炎是衣原體、支原體感染引起；

2、臨床表現不同：淋菌性尿道炎症狀較重，尿頻、尿急、尿痛比較強烈，尿道口較潮紅，膿液較多，黃而黏稠。非淋菌性尿道炎症狀較輕，尿頻、尿急、尿痛輕微，尿道口微紅，膿液稀薄，甚至無症狀；

3、治療用藥不同：淋菌性尿道炎採用三代類頭孢藥物治療，非淋菌性尿道炎採用四環素類藥物治療。