小頭症主要需要手術治療，整體體型較小，如部分小兒身材小，顯得頭小，但非常靈活，整個身材比例非常協調，只是整體外觀類似縮小版，屬於生理性，並非小頭症範疇。小頭症為顱縫早閉表現，是一種全顱縫早閉，在臨床中顱縫早閉分單條顱縫早閉、多條顱縫早閉、全顱縫早閉，屬於最嚴重的全顱縫早閉。

正常小兒生出生後顱縫沒有閉合，可促使大腦生長，大腦生長膨脹後撐大骨頭，頭圍才會增長。但顱縫早閉屬於先天性，在胎兒期顱縫已經閉合，顱縫一旦閉合，因被骨頭限制，大腦無法再生長。所以，小頭症即骨縫都閉合後大腦發育受影響，腦功能、神經功能受到嚴重障礙，兒童常存在智力發育異常。需早期把閉合顱縫打開，通過手術方式重新做顱縫，以解除大腦發育的限制因素。