高血壓腦血栓患者，血壓控制標準和未發生血栓之前不同。沒有發生血栓前，希望血壓控制到140/90mmol/L以下。但是發生腦血栓時，血壓控制要稍微放寬，因為大腦供血需要血管壓力，血壓在150/90mmHg或者低壓100mmHg也能夠接受。

還要進行血管保護以及抗血小板聚集治療，避免再次出現血栓，如使用抗血小板聚集藥物以及他汀類藥物，穩定血管斑塊。腦血栓以後要進行早期功能鍛鍊，有較多堵塞的血管並不能通開，但是可以通過反覆功能鍛鍊，刺激促進側支循環形成，以改善運動能力。