長期尿路感染會引起尿路慢性炎症，如慢性膀胱炎、慢性腎盂腎炎等，治療比較困難，會影響腎功能以及膀胱功能。對於有些慢性炎症，藥物抗生素效果較差，耐藥後會反覆出現，增加精神痛苦。尿路感染主要表現為尿頻、尿急、尿痛，上尿路慢性炎症會出現腰痛。長期感染會引起症狀反覆出現，影響健康、心情以及精神。

慢性炎症後焦慮、抑鬱的情況比較常見，尤其是女性，可影響性生活，性生活易引起尿路感染症狀加重。尿道長期感染後，會引起膀胱黏膜增生，可以引起濾泡增生，發展為成腺性膀胱炎，治療較困難，需要進行手術治療，將腺體、腺泡、濾泡切除，痛苦較大。對於長期的尿路感染，患者需增強體質，多喝水、多運動，選擇更好、更有效的抗生素，才能治療長期、慢性的尿路感染。