引起尿路結石形成的原因較多，常見原因如下：

1、感染：一般與結石互為因果關係，尿路感染是導致尿液形成結石的因素，當結晶濃度過高、過飽和，結晶析出後形成結石。而結石形成後，又可導致尿路感染反覆發生，因此結石和感染是互相促成的關係；

2、尿液排出不暢：包括上尿路和下尿路不暢，引起尿瀦留或殘餘尿量增多。腎臟尿液無法排出，可見於輸尿管梗阻、尿道狹窄、前列腺增生或肥大等，導致腎臟積水、輸尿管擴張，使膀胱殘餘尿量過多。如果尿液在尿路中積存過久，易導致尿液中濃度升高、感染等出現，從而會促進結石發生；

3、藥物因素：部分藥物也易導致結石形成，如頭孢曲松，以及部分代謝相關性藥物，也易導致結石形成；

4、代謝異常：如尿酸結石、胱氨酸結石是尿酸代謝障礙形成。另外，還有部分鈣鹽代謝障礙的結石，可見於甲亢(甲狀腺功能亢進症)、甲旁亢(甲狀旁腺功能亢進)等，也易導致含鈣結石反覆發生；

5、尿路先天性畸形：如馬蹄腎、融合腎、異位腎，或腎盂輸尿管連接處畸形等先天性畸形，可導致尿液排出不暢，也是易導致結石形成的因素。