尿路結石主要包括腎結石、輸尿管結石以及膀胱結石，碎石時也可能造成不利影響。醫生在對腎結石患者進行碎石時，可能會對腎臟造成損傷，導致患者出現腎周血腫而加重血尿，可能還會合並腎周感染，此時造成的損害比結石造成的損害更大。

另外，患者可能存在輸尿管結石及梗阻，但並非完全梗阻，尿液還能從結石周圍流出，但碎石後可能會形成石階，即打碎結石後將輸尿管完全堵死而造成完全梗阻。此時可能會加重患者絞痛的症狀及腎功能損害，還可能會導致患者出現繼發性泌尿系感染。