尿結石並沒有通行的特效藥，尿結石的成分很多，結石質地通常較堅硬，較少有藥物可將結石真正融化或加速排出。因此，絕大多數藥物都只能起到很弱的輔助治療作用。只有特殊成分的結石，如純尿酸結石或純胱氨酸結石中不含有其它的含鈣成分，可通過鹼化尿液的方式調節尿液pH值，加速酸性結石溶解，減少或者減小結石，甚至讓結石完全溶解。

所以結石的治療首先要了解結石的成分，對於純尿酸或者胱氨酸的結石，可以通過口服小蘇打片或口服枸櫞酸鉀的藥劑，鹼化尿液，促進酸性結石溶解，從而達到溶石目的。但對於更為常見的含鈣結石，這類藥物則無效果。