泌尿系統結石是指有無機鹽成分沉積，即沉積到整個泌尿系統中，常見的是產生於腎臟本身，腎臟內分泌出的尿液，如果尿液成分過於濃縮、飽和後，有些尿中的無機鹽成分，比如草酸、鈣，尿酸、磷酸鈣等成分會逐漸析出小顆粒結晶，如同滾雪球，越長越大，形成幾毫米，甚至幾釐米，肉眼可見的結石，是形成泌尿繫結石的主要因素。

結石大多數是在腎內形成，腎內形成結石有可能隨著尿液沿著輸尿管、膀胱、尿道排出體外，也有可能在此過程中，比如在輸尿管、膀胱、尿道形成停留和卡頓，會變成相應的輸尿管結石、膀胱結石、尿道結石。因此絕大多數結石均源自於腎臟，與尿液成分過於濃縮、無機鹽析出等密切相關。