孕早期小便後肚子疼的原因較多，可能是生理性因素導致，也可能是泌尿系疾病、先兆流產等病理性因素所致，病因不同，治療的方案也不相同，具體分為以下幾點：

一、生理性因素：

如果孕婦只是在小便後偶爾出現肚子疼的情況，可能是因為胚胎髮育過程中牽拉子宮導致的肚子疼，子宮在被逐漸撐大的過程中會出現疼痛的感覺，屬於正常情況，無需特殊處理。

二、病理性因素：

1、泌尿系疾病：如果孕早期每次小便後都會出現肚子疼的情況，最常見的就是泌尿系疾病，如急性膀胱炎、尿道炎、膀胱結石、尿道結石等。孕婦可能多伴有尿急、尿頻、尿痛、尿不盡等症狀，甚至出現尿量減少、不排尿等情況，應及時到泌尿外科就診，進行血常規、尿常規、B超檢查等，針對病因進行治療。不管是泌尿系統炎症還是結石，均建議遵醫囑大量喝水，多排尿，以幫助炎症或結石排出。如果炎症較為嚴重，還需口服抗生素進行治療。孕期禁忌體外衝擊波碎石，如果結石造成孕婦疼痛難忍，可視具體情況給予黃體酮藥物緩解；

2、先兆流產：如果在小便後突然出現肚子疼，且同時伴有陰道流血的症狀，應引起重視，可能是先兆流產所致，需要及時就醫，在醫生指導下進行保胎治療。如果保胎失敗，則建議終止妊娠。