後尿道結石如結石嵌頓不能自行排出時，常需要做微創治療，如經尿道鏡或膀胱鏡將結石推入膀胱內，然後在直視下用鈥激光光纖將結石徹底打碎。後尿道結石常會嵌頓在前列腺部尿道或尿道膜部，由於局部嵌頓常不能自行排出體外，需要用尿道探條將結石推入膀胱內，如結石較小時可以採用體外衝擊波治療，將膀胱內結石徹底打碎。

後尿道結石推入膀胱內，結石較大時還應在尿道膀胱鏡下做液電碎石術或超聲氣壓彈道碎石術、體外衝擊波碎石。病人結石打碎後可以用套石籃取出或用液體衝出。後尿道結石病人常合併後尿道狹窄或尿道局部腫脹，當局部腫脹消腫後，部分病人較小的結石可以從尿道順利排出，後尿道結石病人應當及早到泌尿外科進行規範治療。