如果檢查的過程中發現患者睪酮低，首先應該根據詳細的病史詢問、體格檢查、特定的症狀和體徵，再結合實驗室相關的檢查結果而確定病因，要明確導致睪酮低下的原因。對一部分患者，比如由於垂體腫瘤所導致的睪酮低下，最主要的治療應該是針對病因治療，以治療原發病為主，一般都採用外科手術切除腫瘤，或者用伽馬刀或者用放療的方法來解除原發病。對於部分患者給予睪酮替代治療可以取得一定的療效：
1、原發性性腺功能減退症患者應用雄激素替代治療可以促進男性第二性徵的發育和合成代謝；
2、繼發性性腺功能減退患者經過促性腺激素釋放激素脈衝式治療，或者卵泡生成素、黃體生成素聯合治療後如果療效不滿意，可以應用雄激素替代治療；
3、嬰幼兒時期性器官發育不成熟，比如陰莖過小過短，短期應用雄激素也是可以的。
以上幾種情況下應用雄激素治療常常能取得一定的療效。