肛瘻和直腸癌的區別還是比較大的，肛瘻大部分是繼發在肛周膿腫的基礎之上形成的，一般直腸周圍有外口，也就是有紅腫的區域，並且有流膿，流膿的味道比較臭。直腸癌通常表現患者大便有出血，或者大便次數增多、大便變稀、不成形。

行肛門指診的時候，對於肛瘻的患者，能夠觸及到質硬的瘻管通向直腸內，如果患者直腸癌的腫瘤位置比較低，直腸指診能夠觸及到腫瘤的下緣，甚至能夠觸及到整個腫瘤，如果位置比較高，一般直腸指診是陰性的，必要的時候要結合腸鏡檢查來進行明確。