直腸指檢是檢查肛管直腸末端的一種常規檢查方法。醫生手指戴手套並塗上潤滑油，病人側臥位暴露肛門，首先觀察功能外觀，檢查有無禁忌，檢查如果沒有禁忌症，則食指在肛周做環形觸摸了解肛周皮下有無異常腫塊等，然後食指輕柔、緩慢插入肛管，病人放鬆配合檢查。

低位直腸癌可以通過指檢發現，指檢時可以觸及形狀不規則、邊緣不整齊的質硬偏硬性腫塊，表面欠光滑，周圍黏膜增厚，早期可以稍微活動，如果累及腸管全周和侵犯周圍臟器，則腫塊固定，腫塊還可以形成環狀狹窄，指檢之後指套上可以染血，並有黏液及壞死組織。

肛門直腸指檢在有經驗專科醫生檢查，可以提高直腸指檢陽性率，直腸指檢是發現低位直腸最方便、簡單、有效的方法。但平時門診很多患者由於各種原因拒絕檢查，是不明智做法。